Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF2Q96GP6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARF2Q96GP6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms