Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CFAP36Q96G28 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CFAP36Q96G28 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CFAP36Q96G28 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CFAP36Q96G28 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CFAP36Q96G28 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CFAP36Q96G28 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CFAP36Q96G28 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CFAP36Q96G28 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CFAP36Q96G28 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP36Q96G28 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP36Q96G28 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP36Q96G28 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP36Q96G28 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP36Q96G28 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP36Q96G28 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP36Q96G28 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP36Q96G28 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP36Q96G28 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CFAP36Q96G28 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms