Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNFT2Q96EX2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms