Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCC1Q96CN9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCC1Q96CN9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms