Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FAM3DQ96BQ1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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FAM3DQ96BQ1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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FAM3DQ96BQ1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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FAM3DQ96BQ1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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FAM3DQ96BQ1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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FAM3DQ96BQ1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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FAM3DQ96BQ1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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FAM3DQ96BQ1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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FAM3DQ96BQ1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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FAM3DQ96BQ1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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FAM3DQ96BQ1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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