Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM87AQ8NBN3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms