Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DTX3Q8N9I9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms