Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms