Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HECW1Q76N89 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HECW1Q76N89 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms