Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CASC2Q6XLA1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms