Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf220Q5T0J3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf220Q5T0J3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms