Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL12Q53G59 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL12Q53G59 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms