Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRY2Q49AN0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms