Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDNFQ49AH0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDNFQ49AH0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms