Protein–RNA interactions for Protein: Q24JQ0

TMEM241, Transmembrane protein 241, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM241Q24JQ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM241Q24JQ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM241Q24JQ0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms