Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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