Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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