Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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