Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELOBQ15370 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELOBQ15370 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ELOBQ15370 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELOBQ15370 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELOBQ15370 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELOBQ15370 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELOBQ15370 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELOBQ15370 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELOBQ15370 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELOBQ15370 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELOBQ15370 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELOBQ15370 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELOBQ15370 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELOBQ15370 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ELOBQ15370 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELOBQ15370 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms