Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNW1Q13573 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms