Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
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ITGB3BPQ13352 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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ITGB3BPQ13352 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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ITGB3BPQ13352 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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ITGB3BPQ13352 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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ITGB3BPQ13352 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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ITGB3BPQ13352 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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ITGB3BPQ13352 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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ITGB3BPQ13352 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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ITGB3BPQ13352 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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ITGB3BPQ13352 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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ITGB3BPQ13352 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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ITGB3BPQ13352 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB3BPQ13352 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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