Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN3Q13064 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
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