Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDC16Q13042 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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