Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EFEMP1Q12805 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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