Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBQ06643 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBQ06643 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LTBQ06643 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LTBQ06643 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LTBQ06643 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LTBQ06643 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LTBQ06643 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LTBQ06643 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LTBQ06643 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LTBQ06643 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LTBQ06643 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LTBQ06643 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBQ06643 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBQ06643 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBQ06643 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBQ06643 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBQ06643 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBQ06643 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms