Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms