Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms