Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPEP62304 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPEP62304 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPEP62304 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPEP62304 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPEP62304 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPEP62304 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPEP62304 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPEP62304 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPEP62304 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPEP62304 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPEP62304 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPEP62304 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPEP62304 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPEP62304 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPEP62304 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPEP62304 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPEP62304 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNRPEP62304 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPEP62304 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPEP62304 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPEP62304 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPEP62304 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPEP62304 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPEP62304 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPEP62304 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPEP62304 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPEP62304 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPEP62304 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPEP62304 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPEP62304 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPEP62304 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNRPEP62304 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms