Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5BP61020 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms