Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DEFA1P59665 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA1P59665 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms