Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms