Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GBX2P52951 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GBX2P52951 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GBX2P52951 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GBX2P52951 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GBX2P52951 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX2P52951 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX2P52951 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX2P52951 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms