Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHKA1P46020 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHKA1P46020 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms