Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP5P45974 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP5P45974 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP5P45974 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP5P45974 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP5P45974 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP5P45974 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP5P45974 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP5P45974 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP5P45974 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP5P45974 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP5P45974 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP5P45974 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP5P45974 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP5P45974 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP5P45974 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP5P45974 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP5P45974 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP5P45974 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP5P45974 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP5P45974 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP5P45974 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP5P45974 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP5P45974 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP5P45974 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP5P45974 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP5P45974 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP5P45974 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP5P45974 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP5P45974 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP5P45974 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP5P45974 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP5P45974 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP5P45974 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP5P45974 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP5P45974 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP5P45974 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP5P45974 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP5P45974 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP5P45974 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP5P45974 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP5P45974 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP5P45974 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP5P45974 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP5P45974 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP5P45974 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP5P45974 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP5P45974 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP5P45974 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP5P45974 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP5P45974 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP5P45974 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP5P45974 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP5P45974 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP5P45974 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP5P45974 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP5P45974 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP5P45974 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP5P45974 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP5P45974 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP5P45974 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP5P45974 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP5P45974 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP5P45974 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP5P45974 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP5P45974 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP5P45974 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP5P45974 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP5P45974 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP5P45974 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP5P45974 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP5P45974 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP5P45974 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP5P45974 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP5P45974 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP5P45974 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP5P45974 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP5P45974 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP5P45974 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms