Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJC1P36383 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJC1P36383 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJC1P36383 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJC1P36383 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJC1P36383 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJC1P36383 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJC1P36383 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJC1P36383 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJC1P36383 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJC1P36383 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJC1P36383 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GJC1P36383 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJC1P36383 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GJC1P36383 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJC1P36383 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJC1P36383 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJC1P36383 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJC1P36383 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJC1P36383 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJC1P36383 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJC1P36383 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJC1P36383 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJC1P36383 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJC1P36383 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJC1P36383 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJC1P36383 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms