Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCVRNP35243 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms