Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA5P30532 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms