Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms