Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB2P29033 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB2P29033 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB2P29033 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB2P29033 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB2P29033 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB2P29033 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB2P29033 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB2P29033 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB2P29033 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB2P29033 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB2P29033 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB2P29033 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB2P29033 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB2P29033 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB2P29033 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB2P29033 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB2P29033 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB2P29033 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB2P29033 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB2P29033 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB2P29033 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB2P29033 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB2P29033 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB2P29033 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB2P29033 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB2P29033 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB2P29033 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB2P29033 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB2P29033 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB2P29033 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB2P29033 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB2P29033 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB2P29033 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB2P29033 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB2P29033 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB2P29033 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB2P29033 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB2P29033 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB2P29033 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB2P29033 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB2P29033 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB2P29033 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GJB2P29033 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms