Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 31
PTBP1P26599 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 31
PTBP1P26599 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 31
PTBP1P26599 ZWILCH-209ENST00000565627 1845 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 31
PTBP1P26599 SNRNP48-201ENST00000342415 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 31
PTBP1P26599 ZWILCH-202ENST00000446801 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 31
PTBP1P26599 ZWILCH-214ENST00000613446 3181 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 31
PTBP1P26599 ZWILCH-201ENST00000307897 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 31
PTBP1P26599 ZWILCH-211ENST00000567816 373 ntTSL 56.66□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 31
PTBP1P26599 SNRNP48-202ENST00000496946 2610 ntTSL 23.18□□□□□ -1.93e-6■■■■■ 31
PTBP1P26599 LINC02340-202ENST00000620494 573 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 31
PTBP1P26599 DIS3L2-208ENST00000424049 1149 ntTSL 58.91□□□□□ -0.983e-8■■■■■ 31
PTBP1P26599 DIS3L2-216ENST00000498319 564 ntTSL 56.04□□□□□ -1.443e-8■■■■■ 31
PTBP1P26599 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.545e-7■■■■■ 31
PTBP1P26599 COX6B1-201ENST00000246554 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 31
PTBP1P26599 COX6B1-202ENST00000392201 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.265e-7■■■■■ 31
PTBP1P26599 COX6B1-203ENST00000590618 290 ntTSL 35.51□□□□□ -1.535e-7■■■■■ 31
PTBP1P26599 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.663e-7■■■■■ 31
PTBP1P26599 AC069277.1-203ENST00000414603 517 ntTSL 38.19□□□□□ -1.13e-7■■■■■ 31
PTBP1P26599 DLG4-209ENST00000491753 869 ntTSL 210.42□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 31
PTBP1P26599 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.51e-9■■■■■ 31
PTBP1P26599 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.051e-9■■■■■ 31
PTBP1P26599 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-9■■■■■ 31
PTBP1P26599 ARID4B-205ENST00000421364 5151 ntTSL 1 (best)10.68□□□□□ -0.71e-9■■■■■ 31
PTBP1P26599 ARID4B-212ENST00000491632 3823 ntTSL 1 (best)10.46□□□□□ -0.731e-9■■■■■ 31
PTBP1P26599 EPB41-203ENST00000349460 3029 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.841e-13■■■■■ 31
PTBP1P26599 EPB41-207ENST00000373800 2853 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.871e-13■■■■■ 31
PTBP1P26599 EPB41-204ENST00000356093 5857 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -11e-13■■■■■ 31
PTBP1P26599 EPB41-202ENST00000347529 2676 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.071e-13■■■■■ 31
PTBP1P26599 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.181e-13■■■■■ 31
PTBP1P26599 SUGCT-205ENST00000444074 367 ntTSL 519.1■□□□□ 0.654e-6■■■■■ 31
PTBP1P26599 SUGCT-203ENST00000413931 539 ntTSL 415.43■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 31
PTBP1P26599 CHD6-201ENST00000309279 1635 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.134e-7■■■■■ 31
PTBP1P26599 CHD6-205ENST00000440697 1635 ntTSL 57.97□□□□□ -1.134e-7■■■■■ 31
PTBP1P26599 CHD6-207ENST00000476641 862 ntTSL 25.91□□□□□ -1.464e-7■■■■■ 31
PTBP1P26599 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.59e-8■■■■■ 31
PTBP1P26599 RFC3-203ENST00000616236 612 ntTSL 34.32□□□□□ -1.729e-8■■■■■ 31
PTBP1P26599 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.424e-9■■■■■ 31
PTBP1P26599 PARVB-202ENST00000402876 560 ntTSL 1 (best)16.57■□□□□ 0.246e-7■■■■■ 31
PTBP1P26599 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.046e-7■■■■■ 31
PTBP1P26599 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.224e-9■■■■■ 31
PTBP1P26599 STAU2-215ENST00000521727 3953 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.994e-9■■■■■ 31
PTBP1P26599 STAU2-214ENST00000521451 2712 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.094e-9■■■■■ 31
PTBP1P26599 TASP1-207ENST00000483898 754 ntTSL 57.52□□□□□ -1.214e-7■■■■■ 31
PTBP1P26599 TASP1-205ENST00000476108 829 ntTSL 57.52□□□□□ -1.214e-7■■■■■ 31
PTBP1P26599 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.64e-9■■■■■ 31
PTBP1P26599 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.684e-9■■■■■ 31
PTBP1P26599 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.864e-9■■■■■ 31
PTBP1P26599 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.994e-9■■■■■ 31
PTBP1P26599 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.994e-9■■■■■ 31
PTBP1P26599 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.263e-8■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 RFX3-210ENST00000457373 822 ntTSL 57.85□□□□□ -1.153e-8■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 RFX3-201ENST00000302303 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.163e-8■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 RFX3-209ENST00000451859 740 ntTSL 36.51□□□□□ -1.373e-8■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 FNBP1L-204ENST00000424449 1518 ntTSL 28.54□□□□□ -1.045e-8■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 LARP1B-210ENST00000512292 3105 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.961e-8■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 LARP1B-202ENST00000394288 2151 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.131e-8■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 LARP1B-209ENST00000508819 1891 ntTSL 56.96□□□□□ -1.291e-8■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.331e-8■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.411e-8■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.026e-7■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.086e-7■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 SIK3-204ENST00000445177 6331 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.76□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 SIK3-203ENST00000415541 3816 ntTSL 1 (best)7.49□□□□□ -1.216e-7■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 GANAB-203ENST00000524437 671 ntTSL 214.45□□□□□ -0.14e-9■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 AC093157.1-201ENST00000453011 794 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 AC093157.1-202ENST00000446527 1045 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.472e-7■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 SRPK2-209ENST00000476117 703 ntTSL 26.65□□□□□ -1.341e-6■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 SRPK2-213ENST00000485455 436 ntTSL 32.28□□□□□ -2.041e-6■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 EDA-212ENST00000533317 1462 ntTSL 1 (best)19.88■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 EDA-202ENST00000374548 1116 ntTSL 1 (best)19.53■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 EDA-205ENST00000502251 1167 ntTSL 1 (best)16.02■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 EDA-206ENST00000503592 557 ntTSL 56.43□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 EDA-207ENST00000510681 536 ntTSL 44□□□□□ -1.771e-6■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 EDA-211ENST00000530321 339 ntTSL 22.89□□□□□ -1.951e-6■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.516e-11■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 DMBX1-202ENST00000371956 2882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.666e-11■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 LINC02428-203ENST00000513793 438 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.428e-8■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 ZNF133-215ENST00000630056 1999 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.591e-7■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 ZNF133-214ENST00000628216 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 ZNF133-208ENST00000434018 523 ntTSL 37.88□□□□□ -1.151e-7■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 ZNF133-213ENST00000626025 616 ntTSL 57.61□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 ZNF133-202ENST00000360010 481 ntTSL 56.26□□□□□ -1.411e-7■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 GRB2-207ENST00000577711 555 ntTSL 215.75■□□□□ 0.113e-8■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.113e-8■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 30.9
PTBP1P26599 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.223e-8■■■■■ 30.9
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 205.6 ms