Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RAB4AP20338 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RAB4AP20338 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RAB4AP20338 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RAB4AP20338 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RAB4AP20338 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RAB4AP20338 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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