Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms