Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y9

H2AFB1, Histone H2A-Bbd type 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFB1P0C5Y9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFB1P0C5Y9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2AFB1P0C5Y9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms