Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTAP09496 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTAP09496 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTAP09496 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTAP09496 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTAP09496 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTAP09496 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTAP09496 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTAP09496 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTAP09496 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTAP09496 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTAP09496 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTAP09496 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTAP09496 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTAP09496 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTAP09496 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLTAP09496 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLTAP09496 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTAP09496 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTAP09496 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTAP09496 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLTAP09496 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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