Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NMBP08949 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NMBP08949 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NMBP08949 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NMBP08949 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMBP08949 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMBP08949 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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