Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB1P08034 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB1P08034 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB1P08034 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB1P08034 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB1P08034 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB1P08034 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB1P08034 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB1P08034 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB1P08034 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB1P08034 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB1P08034 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB1P08034 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB1P08034 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB1P08034 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB1P08034 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB1P08034 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB1P08034 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB1P08034 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB1P08034 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB1P08034 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB1P08034 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB1P08034 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB1P08034 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB1P08034 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB1P08034 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB1P08034 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB1P08034 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB1P08034 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB1P08034 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB1P08034 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB1P08034 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB1P08034 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB1P08034 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB1P08034 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB1P08034 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB1P08034 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB1P08034 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB1P08034 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB1P08034 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB1P08034 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB1P08034 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB1P08034 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB1P08034 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB1P08034 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB1P08034 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB1P08034 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB1P08034 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB1P08034 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB1P08034 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB1P08034 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB1P08034 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB1P08034 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB1P08034 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB1P08034 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB1P08034 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms