Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNB1P01574 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNB1P01574 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms