Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEMFO60524 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEMFO60524 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEMFO60524 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEMFO60524 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEMFO60524 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEMFO60524 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEMFO60524 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEMFO60524 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEMFO60524 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEMFO60524 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEMFO60524 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEMFO60524 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEMFO60524 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEMFO60524 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEMFO60524 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEMFO60524 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEMFO60524 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEMFO60524 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEMFO60524 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEMFO60524 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEMFO60524 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEMFO60524 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEMFO60524 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEMFO60524 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEMFO60524 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEMFO60524 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEMFO60524 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEMFO60524 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEMFO60524 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEMFO60524 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEMFO60524 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEMFO60524 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEMFO60524 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEMFO60524 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEMFO60524 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEMFO60524 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEMFO60524 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEMFO60524 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEMFO60524 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEMFO60524 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEMFO60524 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEMFO60524 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEMFO60524 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEMFO60524 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms