Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOX15O60248 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX15O60248 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX15O60248 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX15O60248 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX15O60248 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX15O60248 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144 ms