Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AGRNO00468 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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